Фонд выдает гранты сотрудникам музеев РФ на реализацию современных музейных проектов. Важная составляющая программы - семинар для победителей, дающий возможность познакомиться с новыми музейными технологиями, подходами и форматами.

Фонд проводит конкурсы по двум направлениям: стажировки в России и за рубежом и привлечение авторитетных специалистов музейной сферы к участию в мероприятиях, разработке проектов развития и модернизации российских музеев.

Партнерская программа объединяет ресурсы Фонда, возможности и потенциал ведущих российских музеев и некоммерческих организаций для реализации новаторских инициатив музейного сообщества в сферах, связанных со стратегическими приоритетами Фонда.

Фонд на конкурсной основе выдает гранты на продвижение музеев в публичном пространстве, увеличение доступности музейных коллекций. В том числе, посредством их предъявления в сети интернет и поддержки работ по музеефикации ландшафта.

Премия для региональных журналистов, пишущих о культуре. Учредители — Фонд и Государственный Эрмитаж, инициатор — Екатеринбургский музей изобразительных искусств. Премия присуждается журналистам, работающим в городах, где создаются центры-спутники Государственного Эрмитажа.

Ежегодно Фонд организует форум «Музейный гид». Это событие, объединяющее и представляющее все музейные инициативы фонда. Форум включает кураторскую выставку лучших музейных практик и дискуссионную площадку, на которой обсуждаются тенденции развития музейной сферы. Материалами для экспозиции становятся проекты победителей конкурсов «Меняющийся музей в меняющемся мире» и «Музейный десант».

Программа «Культурный прорыв» направлена на поддержку профессионального обмена и сотрудничества в сферах культуры, образования и искусства, на продвижение российского культурного наследия за рубежом.

Фонд выделяет индивидуальные гранты сотрудникам Государственного Эрмитажа. Программой поддержки профессиональной мобильности предусмотрены гранты на научные поездки и стажировки, а программа «За вклад в развитие Эрмитажа» - признание ценности работы сотрудников в различных музейных проектах.

Фонд на конкурсной основе выдавал гранты музеям РФ на публикацию и популяризацию неизвестных и малоизученных музейных коллекций. Уникальные издания распространялись по музеям и библиотекам страны. В настоящее время программа закрыта, реализация поддержанных проектов продолжается. Электронные копии книг доступны сайте www.1p.fondpotanin.ru.

Международный фотоконкурс «МУЗЕЙ. ДИАЛОГ» проводится Благотворительным фондом В. Потанина совместно с ГМВЦ РОСИЗО и Международным советом музеев ИКОМ